Tại bảng A, kết thúc 2 trận đấu cuối cùng tại vòng bảng, cả hai trận đấu giữa U13 Becamex Bình Dương gặp U13 Sông Lam Nghệ An và U13 Bình Dương đối đầu U13 PVF đều kết thúc với tỷ số hoà 0-0. Kết quả này giúp cho U13 Sông Lam Nghệ An giành ngôi nhất bảng với 7 điểm, U13 PVF ở vị trí nhì bảng với 4 điểm.
Ở bảng B, với chiến thắng 2-0 trước U13 VES Bà Rịa - Vũng Tàu, U13 SHB Đà Nẵng kết thúc vòng bảng với 7 điểm. Trong khi đó, U13 Haduwaco Hải Dương giành ngôi nhì bảng với 4 điểm sau chiến thắng 3-0 trước U13 Huế.
Tại bảng C, U13 Nam Định tạo nên cú lội ngược dòng ấn tượng, giành chiến thắng 2-1 trước U13 Hồng Lĩnh Hà Tĩnh, qua đó giành ngôi nhất bảng với 7 điểm. Ngôi nhì bảng thuộc về U13 Hồng Lĩnh Hà Tĩnh với 6 điểm có được sau 2 chiến thắng trước đó. Đáng tiếc cho U13 Quảng Nam khi có chiến thắng huỷ diệt 8-0 trước U13 Navy Phú Nhuận TP. Hồ Chí Minh lượt cuối, nhưng chỉ có được 4 điểm, đành ngậm ngùi ra về.
Ở bảng D, U13 LP Bank Hoàng Anh Gia Lai giành ngôi nhất bảng với 7 điểm sau chiến thắng 2-1 trước U13 Hà Nội. Trong khi đó, U13 TP.Hồ Chí Minh giành ngôi nhì bảng với 5 điểm sau chiến thắng sát nút 1-0 trước U13 Phú Thọ.
Như vậy với kết quả này, 4 trận Tứ kết của giải đấu sẽ lần lượt diễn ra giữa, Tứ kết 1 là cuộc chạm trán giữa U13 Sông Lam Nghệ An đối đầu U13 Hồng Lĩnh Hà Tĩnh; Tứ kết 2, U13 SHB Đà Nẵng đối đầu U13 TP.Hồ Chí Minh; Trận Tứ kết 3 là cuộc thư hùng giữa U13 Nam Định – U13 PVF; trận Tứ kết 4 diễn ra giữa U13 LP Bank Hoàng Anh Gia Lai gặp U13 Haduwaco Hải Dương.
